PMA Nomor 19 Tahun 2019 Pasal 613
Susunan organisasi Kantor Kementerian Agama Kabupaten Minahasa, terdiri atas:
a. Subbagian Tata Usaha
b. Seksi Pendidikan Islam;
c. Seksi Penyelenggaraan Haji dan Umrah;
d. Seksi Bimbingan Masyarakat Islam;
e. Seksi Urusan Agama Kristen;
f. Seksi Pendidikan Kristen;
g. Penyelenggara Zakat dan Wakaf;
h. Penyelenggara Katolik;
i. Kelompok Jabatan Fungsional.