Seksi Pendidikan Kristen sebagaimana dimaksud dalam Pasal 613 huruf f PMA No 19 Tahun 2019 bertugas melakukan pelayanan, bimbingan teknis, pengelolaan data dan informasi, serta penyusunan rencana dan pelaporan di bidang pendidikan agama dan pendidikan keagamaan Kristen.